MFAML: a standard data structure for representing and exchanging metabolic flux models

نویسندگان
چکیده

برای دانلود رایگان متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

MFAML: a standard data structure for representing and exchanging metabolic flux models

SUMMARY MFAML is a standard data structure designed for the formal representation and effective exchange of metabolic flux models. It allows for the explicit description of stationary states of a metabolic system by defining environmental/genetic conditions of the system, e.g. flux measurements, balancing constraints and physiological objectives as well as basic information on metabolites and r...

متن کامل

a new approach to credibility premium for zero-inflated poisson models for panel data

هدف اصلی از این تحقیق به دست آوردن و مقایسه حق بیمه باورمندی در مدل های شمارشی گزارش نشده برای داده های طولی می باشد. در این تحقیق حق بیمه های پبش گویی بر اساس توابع ضرر مربع خطا و نمایی محاسبه شده و با هم مقایسه می شود. تمایل به گرفتن پاداش و جایزه یکی از دلایل مهم برای گزارش ندادن تصادفات می باشد و افراد برای استفاده از تخفیف اغلب از گزارش تصادفات با هزینه پائین خودداری می کنند، در این تحقیق ...

15 صفحه اول

A Protocol for Generating and Exchanging (Genome-Scale) Metabolic Resource Allocation Models

In this article, we present a protocol for generating a complete (genome-scale) metabolic resource allocation model, as well as a proposal for how to represent such models in the systems biology markup language (SBML). Such models are used to investigate enzyme levels and achievable growth rates in large-scale metabolic networks. Although the idea of metabolic resource allocation studies has be...

متن کامل

A compact data structure for representing a dynamic multiset

We develop a data structure for maintaining a dynamic multiset that uses O(n lg lg n/ lg n) bits and O(1) words, in addition to the space required by the n elements stored, supports searches in O(lg n) worst-case time and updates in O(lg n) amortized time. Compared to earlier data structures, we improve the space requirements from O(n) bits to O(n lg lg n/ lg n) bits, but the running time of up...

متن کامل

RNAML: a standard syntax for exchanging RNA information.

Analyzing a single data set using multiple RNA informatics programs often requires a file format conversion between each pair of programs, significantly hampering productivity. To facilitate the interoperation of these programs, we propose a syntax to exchange basic RNA molecular information. This RNAML syntax allows for the storage and the exchange of information about RNA sequence and seconda...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Bioinformatics

سال: 2005

ISSN: 1367-4803,1460-2059

DOI: 10.1093/bioinformatics/bti502